目的分析重庆市高疫情地区病原学检测阴性肺结核的诊断质量现状，为优化相关诊断策略提供科学依据。方法选取重庆市东南和东北地区6个高疫情区县定点医疗机构2023年登记治疗的病原学阴性肺结核患者为研究对象。收集患者的病案资料，由市级专家组现场复核，评价原始诊断质量。结果463例病原学阴性患者中2.3%未开展痰涂片检查，开展痰培养和分子生物学检测的患者分别为60.0%和88.1%。进行抗结核抗体检测的患者为60.5%，进行结核菌素皮肤试验（26.6%）和γ-干扰素释放试验（35.6%）的患者均未超过40.0%。患者均进行了胸部X光片/DR检查，226例患者同时进行了CT检查。其中368例患者胸部影像学结果与当地定点医院原始判读基本一致。16例患者进行了规范的抗感染治疗。44例患者在诊断前按照规范执行了诊断小组讨论。总体诊断符合率为90.1%（417/463），过诊率为6.7%（31/463），漏诊率为3.2%（15/463）。结论重庆市高疫情地区病原学阴性肺结核患者的诊断符合率为90.1%，相关定点医疗机构需提高鉴别活动性肺结核与其他肺部疾病的能力。