目的通过比较肺泡灌洗液免疫荧光染色法、抗酸染色法与靶向高通量测序（t-NGS）检测结核分枝杆菌的效能，评价肺泡灌洗液免疫荧光染色法在肺结核诊断中的应用价值。方法回顾性分析2023年12月至2024年12月该院拟诊为肺部感染的149例患者临床资料。收集患者肺泡灌洗液，分别采用抗酸染色法、免疫荧光染色法、t-NGS检测结核分枝杆菌。以t-NGS检测结果作为参考标准，比较抗酸染色法、免疫荧光染色法与t-NGS的一致性，以及抗酸染色法、免疫荧光染色法诊断结核分枝杆菌的准确率、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值。结果149患者中确诊71例肺结核，免疫荧光染色法的阳性例数为20例，阳性率为28.17%，抗酸染色法的阳性例数为7例，阳性率为9.86%，二者阳性率比较差异有统计学意义（χ 2=7.998，P=0.005）。免疫荧光染色法与t-NGS检测结果比较差异有统计学意义（χ 2=17.381，P<0.001），一致性Kappa值为74.15；抗酸染色法与t-NGS检测结果比较差异有统计学意义（χ 2=5.382，P=0.028），一致性Kappa值为70.32。免疫荧光染色法检测结核分枝杆菌的灵敏度为90.91%，优于抗酸染色法的灵敏度87.50%（P<0.05），但二者特异度无明显差异（P>0.05）。结论肺泡灌洗液免疫荧光染色法在辅助检测结核分枝杆菌方面优于抗酸染色法，在基层疑诊肺结核患者诊断中具有重要的临床意义。