随着国家公立医院高质量发展纵深推进，如何引导公立医院找准建设重心，全面赋能高质量发展是当前亟待解决的重要问题。某军队三甲医院自2023年起创新开展院、科两级年度战略目标管理，因科制宜、精准施策，科学实施季度监测、年中讲评、年底考核，并将考核结果作为人财物等资源配置的重要依据。经过两年多的实践探索，医院学科人才、教学质效、科技创新等均获得明显提升，证实了差异化的战略目标管理是提升机关规划统筹主观能动性、调动科室干事创业内生动力的关键，为新形势下公立医院高质量发展提供借鉴参考。