目的研究支气管肺泡灌洗液（BALF）宏基因组二代测序（mNGS）在老年重症肺炎中的应用价值。方法选取2024年1-8月该院重症病房收治的老年重症肺炎患者48例，按照随机数字表法将其分为观察组及对照组，每组24例。对照组和观察组均在入住ICU 24 h内留取BALF，结合影像学检查选择病变最明显的部位进行灌洗。对照组标本于该院行传统培养；观察组一份标本外送基因检测机构行mNGS检测，另一份标本于该院行传统培养。比较观察组mNGS与同组传统培养、对照组的检测结果，病原体分布情况，患者入住ICU第4、7天的感染指标，预后情况。结果观察组mNGS检测阳性标本率、2种以上病原体标本率均高于同组传统培养和对照组，差异有统计学意义（P<0.05）。除鲍曼不动杆菌、白色念珠菌、光滑假丝酵母菌、植生拉乌尔菌外，观察组在真菌、病毒及少见病原体方面的检出量高于对照组。入住ICU后第4、7天，观察组体温、WBC、C反应蛋白、降钙素原水平均低于对照组，差异有统计学意义（P<0.05）。观察组ICU住院时间、机械通气时间短于对照组，住院费用少于对照组，差异有统计学意义(P<0.05)。结论BALF mNGS有助于早期明确混合病原体和少见病原体，提高阳性检测率、拓宽微生物的范围且缩短检测时间。